在SARS风暴下，台湾连锁加盟协会针对来自全国20,000家门市，约200家企业做的一项调查显示有98%的门市业者表示，受到这波SARS疫情影响，普遍性营业额均有下滑趋势，平均下滑比例更高达21.49%。
为因应SARS所带来的冲击，台湾连锁加盟协会员企业决定以自律运动，号召各商店共同响应，并提出配套措施，吁请政府协助推动，以促使这波SARS疫情的损失降至最低。以下是来自于连锁店业者提出的措施和建议方案：
一．在商店安全部份
业者普遍反应，希望政府能加强业者对门市的因应宣导，让业者有正确的门市防护措施、让顾客安心上门，这些具体建议措施包括：
第一阶段 政令宣导
1.过电视宣导／广播布达政令
2.应明列“正确的作业版本“，呼吁商店共同响应事项
Ａ.正本清源－呼吁消费于出门前应做好体温测试
Ｂ店家主动帮上门的消费者做手部的酒精消毒
Ｃ.以门市面积或从业人员区分等及，规范业者配合抗SARS因应措施
超过10个从业人员以上，或门市超过40平米以上的中大型消费场所
a. 进入门市一律量耳温或额温 b.从业人员及消费者进入应加配戴口罩
Ｄ门市货架、手把、冰箱门把．．等手部经常接触的设备或物品，应每隔2个小时以稀释酒精消毒擦拭
Ｅ.门市配合封馆消毒－可以分区方式，对地区门市进行同步封馆
3.在封馆禁令解除后，政府应为“管制地区门市业者”发起商区再造、促销活动
第二阶段 抗SARS安全商店标章
1. 执行时间：疫情控制较稳定后
2. 编列执行检示人员，就第一阶段执行项目，列入检示范围
二．在政府的商业配套措施方面
根据台湾连锁暨加盟协会调查商店门市业者意见：22%希望政府提供资金融资、39%业者希望免征／缓征营业税、营所税、房屋税、39%希望政府出面协调店面租金降价。
三．“员工薪资贷款”部份
1.条例中“连续两个月营业额较同年二月以前六个月平均或200２年营业额减少30％以上”（部份业者认为两个月的时间太长，营业额减少30%对一般中小型企业，负荷也太大）建议政府是否可可视企业规模或营业额比例，加以调整上述申请条件。
协助劳资协调
无薪休假－协助劳资双方协调
协调员工弹性放假－由特休或法定休假补调
四．第一线门市业者看法：
惠康超市董事长郑朝丰
惠康(welcome)超市集团是国际连锁超市集团的一环；我们很幸运的是有母体公司支持我们可供遵循的BCP(Bussiness Continuted Program)系统，称为非常时期营运正常运作系统。 但是这套系统在同是疫区的新加坡、香港可以适用，而在台湾执行起来就显得困难重重；主要的问题在于政府公权力能否贯彻执行。
举个例子以法令管理来讲，在新加坡或香港只要政府一声令下要民众做好量体温、戴口罩，全民很快就配合执行。在台湾就会碰到许多问题：如民众配合的情绪管理问题；以及耳温计口罩供应不足的问题等等。也因为全民配合不良，以致防疫的漏洞百出。这些漏洞不但造成防疫的效果不彰，而且有许多漏洞要业者花加倍的力气来补，譬如要卖场为顾客量耳温来控制，这样非但让各营业场所要花数倍的人力在自救的工作上，也造成卖场与顾客关系的负面影响。
所以我认为要落实整个社会的防疫工作，最重要的还是要回归到基本面，以公权力来贯彻人的管理。
